Многие формы интерсексуальности восходят к гормональным нарушениям. Иными словами, если во время внутриутробного развития вырабатываемых гормонов недостаточно, или их активность слишком низка, то детерминация мужского пола может остаться незавершенной. Это ведет к двойственности строения внутренних и внешних половых органов, а иногда и внешнего вида человека. Опять же, спектр возможных заболеваний, обусловленных гормональными нарушениями слишком обширен для рамок данного курса. По этой причине в следующих главах в общих чертах приводится описание наиболее распространенных заболеваний. Среди них:

• Врожденная гиперплазия коры надпочечников (ВГКН)
• Синдром нечувствительности к андрогенам (СНА), или Синдром тестикулярной феминизации (СТФ)
• Дефицит 5-альфа-редуктазы (5-АРД)